无菌室亦称无尘室、洁净室或清净室。无菌室的主要功能为室内污染控制，没有无菌室，污染敏感零件不可能批量生产。在FED-STD-2里面，无菌室被定义为具备空气过滤、分配、优化、构造材料和装置的房间，其中特定的规则的操作程序以控制空气悬浮微粒浓度，从而达到适当的微粒洁净度级别。
无菌实验室主要是用于微生物学、生物医学、生物化学、动物实验、基因重组以及生物制品等研究使用的实验室，统称洁净实验室或生物安全实验室。它对于其内部装饰和消毒条件有着非常严格的要求。
无菌室一般设置在微生物实验室内，又称为无菌实验室，是与外界隔离的独立小房间，用板材和玻璃建造。以无菌环境和无菌材料为支持，在保持无菌状态下，才能对某种特定的已知微生物进行研究。所以控菌能力和控菌稳定性是无菌室的核心验收指标。万级无菌室在微生物实验室中比较常见，无菌室包含准备区、缓冲区、无菌室，建造标准需要符合中华人民共和国卫生行业标准:WS233-2002《微生物和生物医学实验室生物安全通用准则》。二级（P2）无菌室为万级、局部百级，包含高、中、初效过滤系统，无菌室的大小，应按每个操作人员占用面积不少于3m²设置，符合目前世界通用的美国联邦209E标准。更衣间及风淋室采用人体自动感应系统。
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